本校應運於民國四十五年九月創立。初為南投縣國姓初級中學，由廖天榜先生兼任校長，旋由陳東榮先生擔任首任校長。初期創校維艱，篳路藍縷。有賴全校師生胼手胝足，闢建校舍，初具規模。民國四十八年由魯佐卿先生接任校長，因魯氏苦心經營，校務得以蒸蒸日上。民國五十七年八月延長九年國教，本校更名為南投縣立國姓國民中學。積極鼓勵鄉內子弟就學，因此學生年有增加。民國六十四年八月一日成立北梅分部，民國六十六年曾正治先生接掌本校，民國六十八年北梅分部奉準獨立為南投縣立北梅國民中學。民國七十二年黃金瑞先生調任本校，為促進地方教育之發展，及適應地方實際之需要，戮力於校舍擴建及設備充實。民國七十九年王錦賜校長接任本校，因人口外流，學生人數驟減，民國八十一年改為偏遠地區學校。民國八十一年九月曾錦泉先生調升本校校長，民國八十七年八月由池麗娟女士接任校長。民國九十一年八月張日新先生調任本校校長。目前全校普通班十一班，特殊班一班，補校一班，共有學生三百餘人，教職員工三十七人。