民國(guó)六十五年八月，臺(tái)北市政府為因應(yīng)松山區(qū)人口成長(zhǎng)與地方急速繁榮，於是年八月選派陳必讀先生擔(dān)任籌備處主任，於松山國(guó)中（現(xiàn)松山高中）成立本校籌備處，展開建校規(guī)劃事宜，以解決本區(qū)子弟就學(xué)問題。

建校之始，篳路藍(lán)縷，幸蒙地方人士及學(xué)生家長(zhǎng)熱心支持，第一期建校工程，計(jì)普通教室十七間、特別教室八間、會(huì)議室一間、辦公室八間、圖書室一間及其他附屬工程。民國(guó)六十六年七月一日本校正式成立，陳必讀先生為首任校長(zhǎng)，是年八月一日招收一年級(jí)新生十班，次年再招收新生十四班，六十八年又招收新生十二班，合計(jì)三十六班，學(xué)生一千六百餘人，教職員工百餘人。

民國(guó)七十七年八月由趙吉林先生接任校長(zhǎng)，一本陳校長(zhǎng)創(chuàng)校之教育理念與建設(shè)藍(lán)圖，積極提升學(xué)生素質(zhì)、加強(qiáng)生活教育、充實(shí)教學(xué)設(shè)備、延攬優(yōu)秀師資，建設(shè)永吉國(guó)中成為理想教育環(huán)境。

民國(guó)八十六年二月徐月娥女士接任第三任校長(zhǎng)，積極推展九年一貫教育，提供豐富多元教學(xué)，建立永吉學(xué)生圖像，以愛為核心，以生命教育為經(jīng)，完全學(xué)習(xí)為緯，融入生活經(jīng)驗(yàn)，培養(yǎng)學(xué)生知法守法，尊重生命的人文素養(yǎng)，主動(dòng)探索研究；積極結(jié)合親師生以卓越創(chuàng)新精神，開發(fā)學(xué)生多元智慧，提升問題解決能力，使吉園學(xué)子能夢(mèng)想未來，築夢(mèng)踏實(shí)，達(dá)到全人發(fā)展的教育目標(biāo)。在徐校長(zhǎng)帶領(lǐng)之下，吉園氣象一新，績(jī)效卓著，於八十八年榮獲臺(tái)北市教育局頒發(fā)推展家庭教育績(jī)優(yōu)團(tuán)體，八十九年榮獲國(guó)中輔導(dǎo)學(xué)會(huì)評(píng)選為輔導(dǎo)績(jī)優(yōu)學(xué)校，九十年榮獲臺(tái)北市教育局評(píng)鑑為特教績(jī)優(yōu)學(xué)校，九十二年度校務(wù)評(píng)鑑榮獲六項(xiàng)特優(yōu)，成為六星級(jí)學(xué)校。

民國(guó)九十二年八月林美雲(yún)女士接任第四任校長(zhǎng)，注重教育理念的融入，以收潛移默化之功能。推動(dòng)教學(xué)卓越化，以激發(fā)學(xué)生潛能，協(xié)助適性發(fā)展；促進(jìn)校園活動(dòng)民主化，培養(yǎng)學(xué)生自治自立精神；拓展活動(dòng)多元化，豐富學(xué)生學(xué)習(xí)生活；並融入社區(qū)資源，為培養(yǎng)未來的卓越社區(qū)公民而努力。在林校長(zhǎng)領(lǐng)導(dǎo)下，「九年一貫課程優(yōu)質(zhì)教育教學(xué)創(chuàng)新專業(yè)發(fā)展徵稿活動(dòng)」榮獲團(tuán)體獎(jiǎng)首獎(jiǎng)，臺(tái)北市第四屆及第五屆「教育專業(yè)創(chuàng)新與行動(dòng)研究成果發(fā)表」皆或團(tuán)體獎(jiǎng)項(xiàng)，本校的籃球隊(duì)、游泳隊(duì)、巧固球隊(duì)等參加全國(guó)性比賽皆戰(zhàn)功彪炳，每年話劇對(duì)外公演，以本校特色之一，成立三年之男生合唱團(tuán)亦於九十六年代表臺(tái)北市參加臺(tái)灣音樂比賽榮獲國(guó)中組第一名，各項(xiàng)表現(xiàn)屢獲佳績(jī)，充分展現(xiàn)永吉師生蹈厲奮發(fā)，與時(shí)具進(jìn)的精神。

民國(guó)九十八年八月林採(cǎi)有女士接篆視事，將本著有教無類、因材施教之教育理念，以愛為核心，用三生(生命、生活、生態(tài))為內(nèi)容，形塑六零環(huán)境，營(yíng)造安全、活力、創(chuàng)意、快樂的學(xué)習(xí)環(huán)境，提供學(xué)生適性發(fā)展機(jī)會(huì)，並培育學(xué)生帶著走的能力，達(dá)成教育111，實(shí)現(xiàn)學(xué)生完全學(xué)習(xí)、全人發(fā)展教育目標(biāo)。