自民國五十七年起實施九年國民教育后，居住本鎮北部之圓富、中正、大林等里及內門鄉永富、永吉、永興、溝坪、金竹等村學生就讀國中殊多不便。鑒此，旗山國中林校長福星及地方士紳盧成輝，徐度群先生大力爭取，并蒙林縣長淵源鼎力支持，即于民國五十九年八月奉準于現址設立高雄縣立旗山國中圓富分部，并派湯民雄先生為分部主任，歷時二載，在全體師生蓽路藍縷，辛勤耕耘，以及地方士紳之協助奠下良基。
于民國六十一年八月奉準獨立設校，并派李國祥先生為首任校長。設址在旗山鎮圓富里旗甲路二段六０九號，校地面積：二．八六一四公頃
民國六十七年八月李校長榮調大樹國中，由校長謝州融先生接任，為加強民族精神教育及陶冶文化氣質，乃籌建精神堡壘及文化走廊。
民國七十二年八月謝校長榮調五甲國中，由校長李亞君先生調掌本校。為改善教學環境，增建家事教室，及生物科實驗教室。
民國七十八年二月李校長榮調大社國中，由校長宋招祿先生接任，宋校長為改善學生飲食及增進學生健康，蒙上級補助及家長贊助，開辦學校午餐，減輕家長負擔。
民國八十一年二月宋校長榮調屏東縣林邊國中，本校學區由于人口外流，班級人數亦隨之減少，省教育廳核定改為偏遠地區學校，并派校長黃瑞光先生接掌，黃校長積極綠美化校園，中庭花園請專家重新規劃、設計，景觀煥然一新，為改善教學效果，設視廳教室。
民國八十二年九月黃校長榮調橋頭國中，由縣教育局督學吳宗立先生接掌本校，兼顧傳統與創新，重視學生讀書風氣及教師研究進修，乃積極爭取經費，充實圖書并特辟教師研究室，鼓勵教師研究進修，充實教學設備，改善教學環境，提升教學品質建立進步、健康和諧的學校。
民國八十五八月吳校長榮調鳥松國中，由縣政府新派校長金清海先生接任。
民國八十八年八月金校長榮調鳥松國中校長，由縣政府新派校長尹鳳珠女士接任。
民國九十年八月尹校長榮調大樹國中，由縣政府教育局副局長黃金花女士榮任本校第九任校長。
民國九十六年八月黃校長調任五甲國中，由原忠孝國中曾宏定先生接任。為現任校長。
