我們的學(xué)校，自1966年起便座落於香港仔的田灣山道。而學(xué)校的歷史，亦起於1966年。簡(jiǎn)單來說，校史可分為「魚類統(tǒng)營(yíng)處香港仔工業(yè)中學(xué)」及「保良局慧妍雅集書院」兩個(gè)時(shí)期。

學(xué)校前身名為「魚類統(tǒng)營(yíng)處香港仔工業(yè)中學(xué)」，由魚類統(tǒng)營(yíng)處?kù)?966-2000年間開辦。它是一所政府津貼的五年制工業(yè)中學(xué)，同學(xué)亦大部份都是來自漁民家庭。由於漁民大多知識(shí)水平較低，部份更是文盲。因此，身為父母，都希望下一代能夠多學(xué)知識(shí)以改善生活。故此，魚類統(tǒng)營(yíng)處在香港仔設(shè)立兩所學(xué)校（我們的學(xué)校及「鴨脷洲小學(xué)」），為漁民子弟提供正規(guī)教育。
學(xué)校成立初期，是一所三年制的實(shí)用中學(xué)。但因?yàn)槟蠀^(qū)中學(xué)學(xué)位需求日增，學(xué)校自1974年開始，便積極籌劃發(fā)展成為一所完整的五年制工業(yè)中學(xué)。到了1978年，教育司署批準(zhǔn)改制，自此，學(xué)校的同學(xué)可以參加中學(xué)會(huì)考。

到了1980年代中，香港的捕漁業(yè)日漸式微。漁業(yè)經(jīng)常出現(xiàn)虧蝕，不少漁民因此放棄漁業(yè)工作，使?jié)O民數(shù)目。此外，由於工業(yè)中學(xué)亦漸漸與主流的文法中學(xué)脫節(jié)。因此，魚類統(tǒng)營(yíng)處把學(xué)校的辦學(xué)權(quán)，於2000年9月交給香港保良局。

香港保良局接手辦學(xué)權(quán)後，把學(xué)校易名為「保良局香港仔中學(xué)」，並轉(zhuǎn)型為文法中學(xué)。不久，學(xué)校獲另一慈善團(tuán)體「慧妍雅集」捐贈(zèng)360萬元，支持學(xué)校的運(yùn)作。為了紀(jì)念這次善舉，香港保良局決定把學(xué)校易名為「保良局慧妍雅集書院」。

學(xué)校秉承了香港保良局的辦學(xué)方針，五育並重，為同學(xué)提供多元化的教育，讓他們汲取知識(shí)，鍛煉體格，掌握共通能力及建立優(yōu)良品格，適應(yīng)未來社會(huì)的需要。

為改善校園環(huán)境及學(xué)習(xí)需要，學(xué)校亦曾經(jīng)進(jìn)行擴(kuò)建，興建了新的教學(xué)樓，於2004年峻工。現(xiàn)時(shí)，學(xué)校樓高六層，共有十七個(gè)標(biāo)準(zhǔn)課室、兩個(gè)會(huì)客室、十個(gè)特別室，其中包括三個(gè)科學(xué)實(shí)驗(yàn)室、資訊科技研習(xí)中心、電腦室、語(yǔ)言室、圖書館、學(xué)生活動(dòng)中心、地理室及音樂室；並設(shè)有禮堂及籃球場(chǎng)。而禮堂、圖書館、所有特別室及課室，都裝有空調(diào)設(shè)備。

其後，學(xué)校獲「保良局李兆忠教育基金」及政府建築署撥款，進(jìn)行了多項(xiàng)改善工程。當(dāng)中包括增建兩個(gè)新課室、大修及翻新禮堂、語(yǔ)言室，以及禮堂音響系統(tǒng)。並購(gòu)置儲(chǔ)物櫃、安裝閉路電視系統(tǒng)等，工程大部份已於2009年峻工。